В 1998 г. создана Группа моделирования белковых структур (заведующий – А.В. Ефимов).
Организована Группа структурных исследований рибосомных белков (заведующий – С.В. Никонов).
Постановлением Академии Наук СССР организован Институт белка, директором которого назначен член-корр. Академии Наук А.С. Спирин.
Лаборатория нуклеиновых кислот и биосинтеза белков (заведующий – А.С. Спирин). Позднее переименована в Лабораторию биосинтеза белка.
Лаборатория физики белков (заведующий – О.Б. Птицын). Позднее переименована в Лабораторию физики белка.
Лаборатория химического синтеза пептидов (заведующий – Ю.В. Митин). Позднее переименована в Лабораторию химии пептидов.
Лаборатория термодинамических конформационных превращений белков (заведующий – П.Л. Привалов). Позднее переименована в Лабораторию термодинамики белка.
Лаборатория оптических свойств белков (заведующий – Ю.Н. Чиргадзе). Позднее переименована в Лабораторию спектроскопии.
Лаборатория сократительных белковых структур (заведующая – А.А. Вазина).
Лаборатория научной информации (заведующий – А.Г. Райхер).
Группа электронной микроскопии (заведующий – В.Д. Васильев). Позднее переименована в Персональную группу В.Д. Васильева.
Группа органического синтеза (заведующий – К.Х. Зихерман).
