Публикации

Публикации за последние 5 лет, ключевые публикации, патенты.

Complementary Packing of α-Helices Revisited

A.V. Efimov

Methods Mol Biol. 2025, 2870: 21-40. doi: 10.1007/978-1-0716-4213-9_2.
Группа моделирования белковых структур
2025
PubMed
Molecular dynamics of twisted β-sheet inside a protein dimer of TTHA1013 Thermus thermophilus

Chirgadze Y.N. , Likhachev I.V. , Balabaev N.K. , Brazhnikov E.V.

Маthematical biology and bioinformatics. 2025 V. 20 № 1. doi: 10.17537/2025.20.
Группа моделирования белковых структур
2025
Скачать файл
статья
Exploring Compactness and Dynamics of Apomyoglobin

Anna V Glyakina, Mariya Y Suvorina, Nikita V Dovidchenko, Natalya S Katina, Alexey K Surin, Oxana V Galzitskaya.
 

Proteins. 2025, 93 (5): 997-1008. doi: 10.1002/prot.26786.
Лаборатория биоинформатических и протеомных исследований, Лаборатория физики белка
2025
PubMed
Combinatorial Effects of CPP-Modified Antimicrobial Peptides: Synergistic and Additive Interactions Against Pathogenic Bacteria

Oxana V. Galzitskaya, Sergey V. Kravchenko, Sergei Y. Grishin, Alena P. Zakhareva, Leila G. Mustaeva , Elena Y. Gorbunova , Alexey K. Surin, Viacheslav N. Azev.
 

Int J Mol Sci. 2025, 26 (13): 5968. doi: 10.3390/ijms26135968.
Лаборатория биоинформатических и протеомных исследований
2025
PubMed
Investigation of new non-toxic inhibitors of fibril formation and preservatives for insulin preparations its analogues

Sergei Y. Grishin, Alexey K. Surin, Oxana V. Galzitskaya.
 

Adv Protein Chem Struct Biol. 2025, 145: 113-143. doi: 10.1016/bs.apcsb.2024.09.013.
Лаборатория биоинформатических и протеомных исследований
2025
PubMed
Formation of an Amyloid-like Structure During In Vitro Interaction of Titin and Myosin-Binding Protein C

Tatiana A. Uryupina, Liya G. Bobyleva, Nikita V. Penkov, Maria A. Timchenko, Azat G. Gabdulkhakov, Anna V. Glyakina, Vadim V. Rogachevsky, Alexey K. Surin, Oxana V. Galzitskaya, Ivan M. Vikhlyantsev, Alexander G. Bobylev .
 

Int J Mol Sci. 2025, 26 (14): 6910. doi: 10.3390/ijms26146910.
Лаборатория биоинформатических и протеомных исследований
2025
PubMed
Unveiling the structure, function and dynamics of StmPr1 in Stenotrophomonas maltophilia virulence

Max Sommer, Amr Negm, Lasse Outzen, Sabine Windhorst, Azat Gabdulkhakov, Wolfgang Weber, Christian Betzel.
 

Sci Rep. 2025, 15 (1): 20193. doi: 10.1038/s41598-025-06177-5.
Группа структурных исследований макромолекулярных комплексов
2025
PubMed
Interaction of phage chaperonin OBP domains with amyloidogenic proteins

Evgeniia V. Leisi, Darya V. Zyurkalova, Uliana F. Dzhus, Alexey D. Nikulin, Sergei A. Golyshev, Vladimir I. Muronetz, Lidia P. Kurochkina
 

Arch Biochem Biophys. 2025, 771: 110493. doi: 10.1016/j.abb.2025.110493.
Лаборатория структурных исследований аппарата трансляции
2025
PubMed
Massively parallel characterization of transcriptional regulatory elements

Vikram Agarwal, Fumitaka Inoue, Max Schubach, Dmitry Penzar, Beth K Martin, Pyaree Mohan Dash, Pia Keukeleire, Zicong Zhang, Ajuni Sohota, Jingjing Zhao, Ilias Georgakopoulos-Soares, William S Noble, Galip Gurkan Yardimci, Ivan V Kulakovskiy, Martin Kircher, Jay Shendure, Nadav Ahituv.
 

Nature. 2025, 639 (8054): 411-420. doi: 10.1038/s41586-024-08430-9.
Группа регуляции биосинтеза белка
2025
PubMed
The Proteins Diversity of the eIF4E Family in the eIF4F Complex

Viktoriya V. Kolesnikova, Oleg S. Nikonov, Tien Do Phat, Ekaterina Yu. Nikonova.

Biochemistry (Mosc). 2025, 90 (Suppl 1): S60-S85. doi: 10.1134/S0006297924603721.
Лаборатория структурных исследований аппарата трансляции
2025
PubMed
Tat-fimbriae ("tafi"): An unusual type of haloarchaeal surface structure depending on the twin-arginine translocation pathway

Anna V. Galeva, Dahe Zhao, Alexey S. Syutkin, Marina Yu. Topilina, Sergei Yu. Shchyogolev, Elena Yu. Pavlova, Olga M. Selivanova, Igor I. Kireev, Alexey K. Surin, Gennady L. Burygin, Jingfang Liu, Hua Xiang, Mikhail G. Pyatibratov.
 

iScience. 2025, 28(2): 111793. doi: 10.1016/j.isci.2025.111793.
Группа надмолекулярных белковых структур, Группа экспериментальных исследований и инженерии олигомерных структур
2025
PubMed
GAME: Genomic API for Model Evaluation

Ishika Luthra, Satyam Priyadarshi, Rui Guo, Lukas Mahieu, Niklas Kempynck, Damion Dooley, Dmitry Penzar, Ilya Vorontsov, Yilun Sheng, Xinming Tu, Adam Klie, Shiron Drusinsky, Alexander Floren, Ethan Armand, Kaur Alasoo, Georg Seelig, Ryan Tewhey, Peter Koo, Vikram Agarwal, Sager Gosai, Luca Pinello, Michael A White, Avantika Lal, Julia Zeitlinger, Katherine S Pollard, Maxwell Libbrecht, Hannah Carter, Sara Mostafavi, Ivan Kulakovskiy, Will Hsiao, Stein Aerts, Jian Zhou, Carl G de Boer 
 

bioRxiv [Preprint]. 2025 Jul: 2025.07.04.663250. doi: 10.1101/2025.07.04.663250
Группа регуляции биосинтеза белка
2025
PubMed
Physics of Ice Nucleation and Antinucleation: Action of Ice-Binding Proteins.

Bogdan S. Melnik, Ksenia A. Glukhova, Evgeniya A. Sokolova (Voronova), Sergiy O. Garbuzynskiy and Alexei V. Finkelstein.

Biomolecules. 2024, 14(1), 54; https://doi.org/10.3390/biom14010054
Группа спектроскопии белка, Лаборатория физики белка
2024
mdpi
Plasma Membrane Blebbing Is Controlled by Subcellular Distribution of Vimentin Intermediate Filaments.

Aleksandra S. Chikina, Anna O. Zholudeva, Maria E. Lomakina, Igor I. Kireev, Alexander A. Dayal, Alexander A. Minin, Mathieu Maurin, Tatyana M. Svitkina and Antonina Y. Alexandrova.
 

Cells 2024, 13(1), 105; https://doi.org/10.3390/cells13010105
Группа клеточной подвижности
2024
mdpi
Molecular dynamics of α-helix inside a protein with single helix.

Yu.N. Chirgadze, I.V. Likhachev, N.K. Balabaev, E.V. Brazhnikov. 

Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 2024. DOI 10.1080/07391102.2024.2308755.
Группа моделирования белковых структур
2024
Скачать файл
tandfonline

Страницы