Публикации

Публикации за последние 5 лет, ключевые публикации, патенты.

Molecular dynamics of α-helical structure: poly-L-glutamic acid.

Y. N. Chirgadze, I. V. Likhachev, N. K. Balabaev, E. V. Brazhnikov.

Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 2023, doi: 10.1080/07391102.2023.2183039
Группа моделирования белковых структур
2023
Скачать файл
tandfonline
Recognition of γ-Subunit by β-Subunit in Translation Initiation Factor 2. Stabilization of the GTP-Bound State of I/F 2 in Archaea and Eukaryotes.

Oleg S. Nikonov, Ekaterina Yu. Nikonova, Anastasiia G. Tarabarova, Alisa O. Mikhaylina, Olesya V. Kravchenko, Natalia A. Nevskaya, Stanislav V. Nikonov.

Biochemistry (Mosc). 2023, 88 (2): 221-230. doi: 10.1134/S0006297923020062.
Группа структурных исследований рибосомных белков, Лаборатория структурных исследований аппарата трансляции
2023
PubMed
The RNA-Binding and RNA-Melting Activities of the Multifunctional Protein Nucleobindin 1.

Alisa Mikhaylina, Arina Svoeglazova, Elena Stolboushkina, Svetlana Tishchenko, Olga Kostareva.

Int J Mol Sci . 2023, 24 (7): 6193. doi: 10.3390/ijms24076193.
Лаборатория структурных исследований аппарата трансляции
2023
PubMed
Yet Another Similarity between Mitochondrial and Bacterial Ribosomal Small Subunit Biogenesis Obtained by Structural Characterization of RbfA from S. aureus.

Aydar G. Bikmullin, Bulat Fatkhullin, Artem Stetsenko, Azat Gabdulkhakov, Natalia Garaeva, Liliia Nurullina, Evelina Klochkova, Alexander Golubev, Iskander Khusainov, Natalie Trachtmann, Dmitriy Blokhin, Albert Guskov, Shamil Validov, Konstantin Usachev, Marat Yusupov.
 

Int J Mol Sci . 2023, 24 (3): 2118. doi: 10.3390/ijms24032118.
Группа структурных исследований макромолекулярных комплексов
2023
PubMed
In Vivo Incorporation of Photoproteins into GroEL Chaperonin Retaining Major Structural and Functional Properties.

Victor Marchenkov, Tanya Ivashina, Natalia Marchenko, Natalya Ryabova, Olga Selivanova, Alexander Timchenko, Hiroshi Kihara, Vladimir Ksenzenko, Gennady Semisotnov.
 

Molecules. 2023, 28 (4): 1901. doi: 10.3390/molecules28041901.
Группа экспериментальных исследований и инженерии олигомерных структур
2023
PubMed
Stabilization of Cereibacter sphaeroides Photosynthetic Reaction Center by the Introduction of Disulfide Bonds.

Georgii Selikhanov, Anastasia Atamas, Diana Yukhimchuk, Tatiana Fufina, Lyudmila Vasilieva, Azat Gabdulkhakov.
 

Membranes (Basel). 2023, 13 (2): 154. doi: 10.3390/membranes13020154.
Группа структурных исследований макромолекулярных комплексов
2023
PubMed
Nonspecific Amyloid Aggregation of Chicken Smooth-Muscle Titin: In Vitro Investigations.

Alexander G. Bobylev, Elmira I. Yakupova, Liya G. Bobyleva, Nikolay V. Molochkov, Alexander A. Timchenko, Maria A. Timchenko, Hiroshi Kihara, Alexey D. Nikulin, Azat G. Gabdulkhakov, Tatiana N. Melnik, Nikita V. Penkov, Michail Y. Lobanov, Alexey S. Kazakov, Miklós Kellermayer, Zsolt Mártonfalvi, Oxana V. Galzitskaya, Ivan M. Vikhlyantsev.
 

Int J Mol Sci . 2023,24 (2):1056. doi: 10.3390/ijms24021056.
Группа структурных исследований макромолекулярных комплексов, Группа экспериментальных исследований и инженерии олигомерных структур, Лаборатория биоинформатических и протеомных исследований, Лаборатория структурных исследований аппарата трансляции
2023
PubMed
EpiFactors 2022: expansion and enhancement of a curated database of human epigenetic factors and complexes.

Daria Marakulina, Ilya E. Vorontsov, Ivan V. Kulakovskiy, Andreas Lennartsson, Finn Drabløs, Yulia A. Medvedeva.
 

Nucleic Acids Res. 2023, 51(D1): 564- 570. doi: 10.1093/nar/gkac989.
Группа регуляции биосинтеза белка
2023
PubMed
Polyribosomes of circular topology are prevalent in mammalian cells.

Timur N. Baymukhametov, Dmitry N. Lyabin, Yury M. Chesnokov 3, Ivan I. Sorokin, Evgeniya V. Pechnikova, Alexander L. Vasiliev, Zhanna A. Afonina.

 

Nucleic Acids Res . 2023, 51 (2): 908-918. doi: 10.1093/nar/gkac1208.
Группа регуляции биосинтеза белка, Лаборатория механизмов биосинтеза белка
2023
PubMed
The Strategies of Development of New Non-Toxic Inhibitors of Amyloid Formation.

Oxana V. Galzitskaya, Sergei Y. Grishin, Anna V. Glyakina, Nikita V. Dovidchenko, Anastasiia V. Konstantinova, Sergey V. Kravchenko, Alexey K. Surin.
 

Review Int J Mol Sci . 2023, 24 (4): 3781. doi: 10.3390/ijms24043781.
Лаборатория биоинформатических и протеомных исследований
2023
PubMed
Comparison of deep learning models with simple method to assess the problem of antimicrobial peptides prediction.

M. Y. Lobanov, M. V. Slizen, N. V. Dovidchenko, A. V. Panfilov, A. A. Surin, I V. Likhachev, O. V. Galzitskaya.
 

Mol Inform . 2023, e2200181. doi: 10.1002/minf.202200181.
Лаборатория биоинформатических и протеомных исследований
2023
PubMed
Properties and Crystal Structure of the Cereibacter sphaeroides Photosynthetic Reaction Center with Double Amino Acid Substitution I(L177)H + F(M197)H.

Tatiana Yu. Fufina, Georgii K. Selikhanov, Azat G. Gabdulkhakov, Lyudmila G. Vasilieva.

Membranes (Basel). 2023, 13 (2): 157. doi: 10.3390/membranes13020157.
Группа структурных исследований макромолекулярных комплексов
2023
PubMed
A New Bacteriophage Of The Family Siphoviridae Isolated From The Soddy-Podzolic Soils Of The Prioksko-Terrasny Nature Reserve.

A. N. Nikulina, N. A. Ryabova, Y. Lu, A. A. Zimin.

Geography, Environment, Sustainability. 2023, 16 (1): 111-118. doi: 10.24057/2071-9388-2022-050.
Группа экспериментальных исследований и инженерии олигомерных структур
2023
elibrary
Protein structure prediction using the evolutionary algorithm USPEX.

Pavel Rachitskii, Ivan Kruglov, Alexei V. Finkelstein, Artem R. Oganov.

Proteins: structure, function and bioinformatics. 2023, 1-11. doi: 10.1002/prot.26478
Лаборатория физики белка
2023
elibrary
The gene regulation knowledge commons: the action area of GREEKC.

Martin Kuiper, Joseph Bonello, Jesualdo T. Fernández-Breis, Philipp Bucher, Matthias E. Futschik, Pascale Gaudet, Ivan V. Kulakovskiy, Luana Licata, Colin Logie, Ruth C. Lovering, Vsevolod J. Makeev, Sandra Orchard, Simona Panni, Livia Perfetto, David Sant, Stefan Schulz, Steven Vercruysse, Daniel R. Zerbino, Astrid Lægreid.
 

Biochim Biophys Acta Gene Regul Mech. 2022; 1865 (1): 194768. doi: 10.1016/j.bbagrm.2021.194768.
Группа регуляции биосинтеза белка
2022
PubMed

Страницы