Публикации

Публикации за последние 5 лет, ключевые публикации, патенты.

ANANASTRA: annotation and enrichment analysis of allele-specific transcription factor binding at SNPs.

Alexandr Boytsov, Sergey Abramov, Ariuna Z. Aiusheeva, Alexandra M. Kasianova, Eugene Baulin, Ivan A. Kuznetsov, Yurii S. Aulchenko, Semyon Kolmykov, Ivan Yevshin, Fedor Kolpakov, Ilya E. Vorontsov, Vsevolod J. Makeev, Ivan V. Kulakovskiy.
 

Nucleic Acids Res. 2022, 50 (1):W51-W56. doi: 10.1093/nar/gkac262.
Группа регуляции биосинтеза белка
2022
PubMed
Structure-Function Relationships in Temperature Effects on Bacterial Luciferases: Nothing Is Perfect.

Anna A. Deeva, Albert E. Lisitsa, Lev A. Sukovatyi, Tatiana N. Melnik, Valentina A. Kratasyuk, Elena V. Nemtseva.

Int J Mol Sci. 2022, 23 (15): 8119. doi: 10.3390/ijms23158119.
Группа термодинамики белка
2022
PubMed
Differential Impact of Hexuronate Regulators ExuR and UxuR on the Escherichia coli Proteome.

Tatiana A. Bessonova, Maria S. Fando, Olga S. Kostareva, Maria N. Tutukina, Olga N. Ozoline, Mikhail S. Gelfand, Alexey D. Nikulin, Svetlana V Tishchenko.
 

Int J Mol Sci. 2022 Jul 29;23(15):8379. doi: 10.3390/ijms23158379.
Группа структурных исследований рибосомных белков, Лаборатория структурных исследований аппарата трансляции
2022
PubMed
Some useful ideas for multistate protein design: Effect of amino acid substitutions on the multistate proteins stability and the rate of protein structure formation.

M. A. Majorina, T. N. Melnik, A. S. Glukhov, B. S. Melnik.

Front Mol Biosci. 2022, 9: 983009. doi: 10.3389/fmolb.2022.983009.
Группа генной инженерии, Группа спектроскопии белка
2022
PubMed
The zinc ions stabilize the three-dimensional structure and are required for the binding of staphylococcal enterotoxin-like protein P (SEIP) with MHC-II receptors.

Irina Shulcheva, Margarita Shchannikova, Bogdan Melnik, Ksenia Fursova, Svetlana Semushina, Anna Zamyatina, Vladimir Oleinikov, Fedor Brovko.
 

Protein Expr Purif. 2022, 197:106098. doi: 10.1016/j.pep.2022.106098.
Группа спектроскопии белка
2022
PubMed
CCP4 Cloud for structure determination and project management in macromolecular crystallography.

Eugene Krissinel, Andrey A. Lebedev, Ville Uski, Charles B. Ballard, Ronan M. Keegan, Oleg Kovalevskiy, Robert A. Nicholls, Navraj S. Pannu, Pavol Skubák, John Berrisford, Maria Fando, Bernhard Lohkamp, Marcin Wojdyr, Adam J. Simpkin, Jens M. H. Thomas, Christopher Oliver, Clemens Vonrhein, Grzegorz Chojnowski, Arnaud Basle, Andrew Purkiss, Michail N. Isupov, Stuart McNicholas, Edward Lowe, Josep Triviño , Kevin Cowtan, Jon Agirre , Daniel J. Rigden, Isabel Uson , Victor Lamzin, Ivo Tews, Gerard Bricogne, Andrew G. W. Leslie , David G. Brown 

Acta Crystallogr D Struct Biol. 2022, 78 (9): 1079-1089. doi: 10.1107/S2059798322007987.
Группа структурных исследований рибосомных белков
2022
PubMed
Y98 Mutation Leads to the Loss of RsfS Anti-Association Activity in Staphylococcus aureus.

Bulat Fatkhullin, Alexander Golubev, Natalia Garaeva, Shamil Validov, Azat Gabdulkhakov, Marat Yusupov.
 

Int J Mol Sci. 2022, 23 (18):10931. doi: 10.3390/ijms231810931.
Группа структурных исследований макромолекулярных комплексов
2022
PubMed
Extended disordered regions of ribosome-associated NAC proteins paralogs belong only to the germline in Drosophila melanogaster.

Galina L. Kogan, Elena A. Mikhaleva, Oxana M. Olenkina, Sergei S. Ryazansky, Oxana V. Galzitskaya, Yuri A. Abramov, Toomas A. Leinsoo, Natalia V. Akulenko, Sergey A. Lavrov, Vladimir A. Gvozdev.
 

Sci Rep. 2022, 1;12 (1):11191. doi: 10.1038/s41598-022-15233-3.
Лаборатория биоинформатических и протеомных исследований
2022
PubMed
GTRD: an integrated view of transcription regulation.

Semyon Kolmykov, Ivan Yevshin, Mikhail Kulyashov, Ruslan Sharipov, Yury Kondrakhin, Vsevolod J. Makeev, Ivan V. Kulakovskiy, Alexander Kel, Fedor Kolpakov.

Nucleic Acids Res. 2021; 49 (D1): D104-D111. doi: 10.1093/nar/gkaa1057.
Группа регуляции биосинтеза белка
2021
PubMed
Regulation of Ribosomal Protein Synthesis in Prokaryotes.

A.O. Mikhaylina, E.Y. Nikonova, O.S. Kostareva, S.V. Tishchenko.

Mol Biol (Mosk). 2021; 55 (1): 20-41. doi: 10.31857/S0026898421010110.
Лаборатория структурных исследований аппарата трансляции
2021
PubMed
Associations between Neurological Diseases and Mutations in the Human Glycyl-tRNA Synthetase.

Ekaterina S. Vinogradova, Oleg S. Nikonov, Ekaterina Yu. Nikonova.

Biochemistry (Mosc). 2021; 86 (Suppl 1): S12-S23. doi: 10.1134/S0006297921140029.
Лаборатория структурных исследований аппарата трансляции
2021
PubMed
Diversity of LSM Family Proteins: Similarities and Differences.

Natalia V. Lekontseva, Elena A. Stolboushkina, Alexey D. Nikulin.

Biochemistry (Mosc). 2021; 86 (Suppl 1): S38-S49. doi: 10.1134/S0006297921140042.
Группа структурных исследований рибосомных белков, Лаборатория структурных исследований аппарата трансляции
2021
PubMed
Assessing Ribosome Distribution Along Transcripts with Polarity Scores and Regression Slope Estimates.

Ilya E. Vorontsov, Artyom A. Egorov, Aleksandra S. Anisimova , Irina A. Eliseeva , Vsevolod J. Makeev, Vadim N. Gladyshev, Sergey E. Dmitriev, Ivan V. Kulakovskiy. 

Methods Mol Biol. 2021; 2252: 269-294. doi: 10.1007/978-1-0716-1150-0_13.
Группа регуляции биосинтеза белка
2021
PubMed
Sequence and evolutionary analysis of bacterial ribosomal S1 proteins.

Evgeniya Deryusheva, Andrey Machulin, Maxim Matyunin, Oxana Galzitskaya.

Proteins. 2021. doi: 10.1002/prot.26084. Online ahead of print.
Лаборатория биоинформатических и протеомных исследований
2021
PubMed
Myosin Binding Protein-C Forms Amyloid-Like Aggregates In Vitro.

Liya G. Bobyleva, Sergey A. Shumeyko, Elmira I. Yakupova , Alexey K. Surin, Oxana V. Galzitskaya, Hiroshi Kihara, Alexander A. Timchenko, Maria A. Timchenko, Nikita V.  Penkov, Alexey D. Nikulin, Mariya Yu. Suvorina, Nikolay V. Molochkov, Mikhail Yu. Lobanov, Roman S. Fadeev, Ivan M. Vikhlyantsev, Alexander G. Bobylev.

Int J Mol Sci. 2021; 22 (2):731. doi: 10.3390/ijms22020731.
Группа экспериментальных исследований и инженерии олигомерных структур, Лаборатория биоинформатических и протеомных исследований, Лаборатория структурных исследований аппарата трансляции
2021
PubMed

Страницы