Публикации

Публикации за последние 5 лет, ключевые публикации, патенты.

LegNet: a best-in-class deep learning model for short DNA regulatory regions.

Dmitry Penzar, Daria Nogina, Elizaveta Noskova, Arsenii Zinkevich, Georgy Meshcheryakov, Andrey Lando, Abdul Muntakim Rafi, Carl de Boer, Ivan V Kulakovskiy.
 

Bioinformatics. 2023, 39 (8): btad457. doi: 10.1093/bioinformatics/btad457.
Группа регуляции биосинтеза белка
2023
PubMed
rs71327024 Associated with COVID-19 Hospitalization Reduces CXCR6 Promoter Activity in Human CD4+ T Cells via Disruption of c-Myb Binding.

Aksinya N. Uvarova, Ekaterina M. Stasevich, Alina S. Ustiugova, Nikita A. Mitkin, Elina A. Zheremyan, Savely A. Sheetikov, Ksenia V. Zornikova, Apollinariya V. Bogolyubova, Mikhail A. Rubtsov, Ivan V. Kulakovskiy, Dmitry V. Kuprash, Kirill V. Korneev, Anton M. Schwartz.
 

Int J Mol Sci. 2023, 24 (18): 13790. doi: 10.3390/ijms241813790.
Лаборатория механизмов биосинтеза белка
2023
PubMed
Creation of New Antimicrobial Peptides.

Oxana V. Galzitskaya.

Int J Mol Sci. 2023, 24 (11): 9451. doi: 10.3390/ijms24119451.
Лаборатория биоинформатических и протеомных исследований
2023
PubMed
Diversity and features of proteins with structural repeats.

Evgeniya I. Deryusheva, Andrey V. Machulin, Oxana V. Galzitskaya.

Biophys Rev. 2023, 15 (5): 1159-1169. doi: 10.1007/s12551-023-01130-0. eCollection 2023 Oct.
Лаборатория биоинформатических и протеомных исследований
2023
PubMed
First Report of Lysozyme Amyloidosis with p.F21L/T88N Amino Acid Substitutions in a Russian Family.

Mariya Yu. Suvorina1, Elena A. Stepanova, Vilen V. Rameev, Lidiya V. Kozlovskaya, Anatoly S. Glukhov, Anastasiya A. Kuznitsyna, Alexey K. Surin, Oxana V. Galzitskaya.
 

Int J Mol Sci. 2023, 24 (19): 14453. doi: 10.3390/ijms241914453.
Лаборатория биоинформатических и протеомных исследований
2023
PubMed
Clarification to "Protein folding problem: enigma, paradox, solution".

Alexei V. Finkelstein, Natalya S. Bogatyreva, Dmitry N. Ivankov, Sergiy O. Garbuzynskiy.

Biophys Rev. 2023, 15 (2): 161. doi: 10.1007/s12551-023-01058-5. eCollection 2023 Apr.
Лаборатория физики белка
2023
PubMed
Protein structure prediction using the evolutionary algorithm USPEX.

Pavel Rachitskii, Ivan Kruglov, Alexei V. Finkelstein, Artem R. Oganov.

Proteins. 2023, 91 (7): 933-943. doi: 10.1002/prot.26478. Epub 2023 Mar 2.
Лаборатория физики белка
2023
PubMed
The P-Site Loop of the Universally Conserved Bacterial Ribosomal Protein L5 Is Required for Maintaining Both Translation Rate and Fidelity.

Mikhail G. Bubunenko, Alexey P. Korepanov.

Int J Mol Sci. 2023, 24 (18): 14285. doi: 10.3390/ijms241814285.
Лаборатория структурных исследований аппарата трансляции
2023
PubMed
Измерительный блок многоканального микрокалориметра.

Бирюков С.В., Сенин А.А., Сенин А.А.

Патент на полезную модель RU217232U1
Группа термодинамики белка
2023
patents
The gene regulation knowledge commons: the action area of GREEKC.

Martin Kuiper, Joseph Bonello, Jesualdo T. Fernández-Breis, Philipp Bucher, Matthias E. Futschik, Pascale Gaudet, Ivan V. Kulakovskiy, Luana Licata, Colin Logie, Ruth C. Lovering, Vsevolod J. Makeev, Sandra Orchard, Simona Panni, Livia Perfetto, David Sant, Stefan Schulz, Steven Vercruysse, Daniel R. Zerbino, Astrid Lægreid.
 

Biochim Biophys Acta Gene Regul Mech. 2022; 1865 (1): 194768. doi: 10.1016/j.bbagrm.2021.194768.
Группа регуляции биосинтеза белка
2022
PubMed
Search for Structural Basis of Interactions of Biogenic Amines with Human TAAR1 and TAAR6 Receptors.

Anna V. Glyakina, Constantine D. Pavlov, Julia V. Sopova, Raul R. Gainetdinov, Elena I. Leonova, Oxana V. Galzitskaya.

Int. J. Mol. Sci. 2022; 23: 209. doi: 10.3390/ijms23010209.
Лаборатория биоинформатических и протеомных исследований
2022
mdpi
YB-1 Phosphorylation at Serine 209 Inhibits Its Nuclear Translocation.

Ekaterina M. Sogorina, Ekaterina R. Kim, Alexey V. Sorokin, Dmitry N. Lyabin, Lev P. Ovchinnikov, Daria A. Mordovkina, Irina A. Eliseeva.

Int. J. Mol. Sci. 2022; 23 (1): 428. doi: 10.3390/ijms23010428.
Группа регуляции биосинтеза белка
2022
mdpi
Multiple Antimicrobial Effects of Hybrid Peptides Synthesized Based on the Sequence of Ribosomal S1 Protein from Staphylococcus aureus.

Sergey V. Kravchenko, Pavel A. Domnin, Sergei Y. Grishin, Alexander V. Panfilov, Viacheslav N. Azev, Leila G. Mustaeva, Elena Y. Gorbunova, Margarita I. Kobyakova, Alexey K Surin, Anna V. Glyakina, Roman S. Fadeev, Svetlana A. Ermolaeva, Oxana V. Galzitskaya
 

Int. J. Mol. Sci. 2022; 23 (1): 524. doi: 10.3390/ijms23010524.
Лаборатория биоинформатических и протеомных исследований
2022
mdpi
Investigation of lipolytic activity of the red king crab hepatopancreas homogenate by NMR spectroscopy.

M. Timchenko, V. Molchanov, M. Molchanov, A. Timchenko, E. Sogorin.

PeerJ. 2022; 10:e12742. doi: 10.7717/peerj.12742.
Группа экспериментальных исследований и инженерии олигомерных структур
2022
peerj
Functional identification of ‘hypothetical protein’ structures with unknown function.

Y. N. Chirgadze, E. A. Boshkova, A. M. Kargatov, N.Y. Chirgadze.

J. Biomol. Struct. Dynamics, 42: 1-5. doi: 10.1080/07391102.2022.2085806
Группа моделирования белковых структур
2022
Скачать файл
PubMed

Страницы