Центр коллективного пользования

Центр коллективного пользования Института белка РАН образован по решению Учёного совета от 12 мая 2012 г., протокол №3, с целью развития приборной базы и экспериментальных установок, повышения эффективности и более рационального использования аналитического, диагностического и технологического оборудования, обновления, модернизации и поддержания работоспособности приборного оснащения Института.

Основными направлением деятельности ЦКП является обеспечение на имеющемся оборудовании проведения исследований, а также оказание услуг исследователям и научным коллективам как базовой организации, так и иным заинтересованным пользователям.

Комплекс масс-спектрометрии

Масс-спектрометр LCQ DECA XP plus (Thermo Finnigan, USA). Предназначен как для исследовательских целей, так и для рутинной аналитической работы

Масс-спектрометр оснащен 4 сменными блоками ионизации: электроспрей, лазерная десорбция в матрице, микроспрей и блок химической и фотоионизации. Система регистрации состоит из квадрупольного и октапольного фильтров и йонной ловушки, что позволяет получать спектры MSn вплоть до 10 степени. Высокое разрешение прибора и возможность регистрировать MSn спектры позволяет работать с ионами частиц весом до 30 кДа, осуществлять контроль чистоты образцов и определять аминокислотную последовательность пептидов и посттрансляционные модификации. Хроматографическая система используется для предварительного разделения пептидов и подключается непосредственно ко входу Масс-спектрометра. Таким образом, ввод образцов осуществляется либо с хроматографической системы, либо со шприца (для электроспрея, химической и фотоионизации), либо с матрицы (лазерная десорбция в матрице).

Комплекс атомно-силовой микроскопии

Зондовая нанолаборатория ИНТЕГРА Вита (НТ-МДТ, Россия). Предназначена для исследований белков, нуклеиновых кислот, вирусов, бактерий, эукариотических клеток и их компонентов, тканей.

Прибор запущен 18 Ноября 2008 г.

Основные технические характеристики.

Конфигурация прибора базируется на инвертированном оптическом микроскопе и включает следующие основные системы и блоки:
базовый блок,  инвертированный оптический микроскоп, измерительный блок, измерительную головку, оптическое сменное основание, жидкостные ячейки,  защитный колпак,  систему видеонаблюдения,  систему виброизоляции, систему управления, СЗМ контроллер, термоконтроллер, компьютер, интерфейсную плату

Измерительные методики

  • Контактная АСМ
  • Полуконтактная АСМ
  • Латерально-Силовая Микроскопия
  • Отображение Адгезионных Сил
  • Метод Модуляции Силы
  • Метод Отображения Фазы
  • АСМ Литография

Размер образца: от долей нанометра до 100 мм в диаметре и до 15 мм в высоту. Область сканирования: от 1 мкм до 100 мкм. Разрешающая способность прибора определяются методикой измерений и физическими параметрами зонда. Используются зонды с радиусом острия до 1 нм. 

Комплекс рентгеноструктурного анализа

Система X8 PROTEUM (Bruker AXS). Предназначена для получения дифракционных данных высокого разрешения с единичных кристаллов макромолекул (белков).

Состав системы: рентгеновский генератор MICROSTAR™, детектор рентгеновских лучей PLATINUM 135 CCD, рентгеновская оптика HELIOS, четырехкружных каппа-гониометр. Дополнен системой охлаждения кристаллов жидким азотом в пучке рентгеновских лучей Cryojet (Oxford Instruments) и детектором рентгеновских лучей Image Plate MAR345 (MAR Research).

Прибор в текущей комплектации введен в эксплуатацию в 2006 г.

Область применения: рентгеноструктурный анализ макромолекул. Комплекс позволяет регистрировать рассеянные с кристаллов рентгеновские лучи, что позволяет определять структуры как макромолекул (белки, РНК, ДНК, их комплексы), так и небольших органических веществ (лекарств, комплексов металлов с органическими молекулами и т.д.). Может быть также использован для получения рентгенограмм с упорядоченных волокон и т.п.

Основные технические характеристики

  • Рентгеновский генератор: нагрузка на вращающийся анод 27 кВт/мм2, размер фокального пятна 100 мкм.
  • Детектор PLATINUM: число пикселей 4096х4096 (16 млн. пикселей), диаметр 135 мм, низкий уровень шума, время считывания изображений - меньше 1 сек.
  • Детектор MAR345: размер пикселя 150 мкм, диаметр 345 мм, низкий уровень шума, время считывания изображения – от 1 мин. до 2.5 мин. в зависимости от рабочего размера детектора.
  • Охлаждение Cryojet: охлаждение струей азота при температуре до 100К, потребление жидкого азота – около 50 л/сут.

Данная система позволяет получать рентгенограммы с кристаллов макромолекул с разрешением до 1.6 Å при размере кристалла около 0.2 мм в поперечнике и размере молекулы около 50 кДа. Время получения полного набора данных зависит от размера кристалла, размера белка, параметров ячейки кристалла и составляет от 3 до 24 часов. Параметры системы практически эквивалентны или превосходят уровень синхротронных источников рентгеновских лучей 1-2 поколений без дополнительных устройств.