Лаборатория химического синтеза пептидов (заведующий – Ю.В. Митин). Позднее переименована в Лабораторию химии пептидов.
Лаборатория термодинамических конформационных превращений белков (заведующий – П.Л. Привалов). Позднее переименована в Лабораторию термодинамики белка.
Лаборатория оптических свойств белков (заведующий – Ю.Н. Чиргадзе). Позднее переименована в Лабораторию спектроскопии.
Лаборатория сократительных белковых структур (заведующая – А.А. Вазина).
Лаборатория научной информации (заведующий – А.Г. Райхер).
Группа электронной микроскопии (заведующий – В.Д. Васильев). Позднее переименована в Персональную группу В.Д. Васильева.
Группа органического синтеза (заведующий – К.Х. Зихерман).
Группа препаративной биохимии белков (заведующая – М.Б. Гарбер).
Лаборатория химии белка (заведующий – Ю.Б. Алахов).
Группа стереохимии белков и нуклеиновых кислот (заведующий – В.И. Лим).
Группа физики нуклеопротеидов (заведующий – И.Н. Сердюк).
Лаборатория регуляции биосинтеза белка (заведующий – Л.П. Овчинников).
Лаборатория молекулярной генетики (заведующий – Н.И. Матвиенко).
Группа биохимии вирусных РНК (заведующий – А.Б. Четверин).
Группа надмолекулярных белковых структур (заведующий – О.В. Фёдоров).
На базе Лаборатории механизмов биосинтеза белка организована Группа белковой инженерии (заведующий – А.Т. Гудков).
