Международная группа исследователей представила результаты масштабного проекта «Кодовая книга», посвящённого определению последовательностей ДНК, распознаваемых факторами транскрипции человека. Эти белки управляют активностью генов, однако для сотен из них сайты связывания оставались неизвестными, а для изученных – не всегда было ясно, насколько известные данные достоверны для живой клетки.
Авторы провели более 4000 экспериментов, сочетая методы in vitro и in vivo, и охарактеризовали 332 транскрипционных фактора. Мотивы связывания удалось получить для 177 белков (53% от общего числа), причём большинство из них оказались уникальными для одного конкретного фактора. Таким образом, словарь узнаваемых последовательностей расширен примерно на 130 новых мотивов.
В итоге в геноме человека идентифицированы десятки тысяч ранее неизвестных, эволюционно консервативных и прямых сайтов связывания транскрипционных факторов. Эти участки преимущественно локализованы в промоторных областях генов и позволяют прогнозировать уровень их экспрессии.
Проект «Кодовая книга» – это важный шаг в понимании механизмов реализации информации, содержащейся в геноме человека.
В консорциум Codebook (Кодовая книга) входят биоинформатики из Института белка РАН, доктор биологических наук Иван Кулаковский, аспиранты ИБ РАН – Георгий Мещеряков и Андрей Буян.
Результаты работы оформлены в статью:
Arttu Jolma, Kaitlin U. Laverty, Ali Fathi, Ally W. H. Yang, Isaac Yellan, Ilya E. Vorontsov, Antoni J. Gralak, Judith F. Kribelbauer-Swietek, Sachi Inukai, Rozita Razavi, Mihai Albu, Alexander Brechalov, Zain M. Patel, Vladimir Nozdrin, Georgy Meshcheryakov, Andrey Buyan, Ivan Kozin, Sergey Abramov, Alexandr Boytsov, The Codebook Consortium, Quaid Morris, Matthew T. Weirauch, Oriol Fornes, Vsevolod J. Makeev, Jan Grau, Ivo Grosse, Philipp Bucher, Bart Deplancke, Ivan V. Kulakovskiy & Timothy R. Hughes. An expanded codebook of human transcription factor DNA-binding specificity. // Nature. 2026. DOI: 10.1038/s41586-026-10798-9
По материалам данной статьи на портале PCRNEWS опубликован пресс-релиз «Геномная «шифровальная книга» – ключ к пониманию генной регуляции у человека».
Array
(
[und] => Array
(
[0] => Array
(
[value] =>
Международная группа исследователей представила результаты масштабного проекта «Кодовая книга», посвящённого определению последовательностей ДНК, распознаваемых факторами транскрипции человека. Эти белки управляют активностью генов, однако для сотен из них сайты связывания оставались неизвестными, а для изученных – не всегда было ясно, насколько известные данные достоверны для живой клетки.
Авторы провели более 4000 экспериментов, сочетая методы in vitro и in vivo, и охарактеризовали 332 транскрипционных фактора. Мотивы связывания удалось получить для 177 белков (53% от общего числа), причём большинство из них оказались уникальными для одного конкретного фактора. Таким образом, словарь узнаваемых последовательностей расширен примерно на 130 новых мотивов.
В итоге в геноме человека идентифицированы десятки тысяч ранее неизвестных, эволюционно консервативных и прямых сайтов связывания транскрипционных факторов. Эти участки преимущественно локализованы в промоторных областях генов и позволяют прогнозировать уровень их экспрессии.
Проект «Кодовая книга» – это важный шаг в понимании механизмов реализации информации, содержащейся в геноме человека.
В консорциум Codebook (Кодовая книга) входят биоинформатики из Института белка РАН, доктор биологических наук Иван Кулаковский, аспиранты ИБ РАН – Георгий Мещеряков и Андрей Буян.
Результаты работы оформлены в статью:
Arttu Jolma, Kaitlin U. Laverty, Ali Fathi, Ally W. H. Yang, Isaac Yellan, Ilya E. Vorontsov, Antoni J. Gralak, Judith F. Kribelbauer-Swietek, Sachi Inukai, Rozita Razavi, Mihai Albu, Alexander Brechalov, Zain M. Patel, Vladimir Nozdrin, Georgy Meshcheryakov, Andrey Buyan, Ivan Kozin, Sergey Abramov, Alexandr Boytsov, The Codebook Consortium, Quaid Morris, Matthew T. Weirauch, Oriol Fornes, Vsevolod J. Makeev, Jan Grau, Ivo Grosse, Philipp Bucher, Bart Deplancke, Ivan V. Kulakovskiy & Timothy R. Hughes. An expanded codebook of human transcription factor DNA-binding specificity. // Nature. 2026. DOI: 10.1038/s41586-026-10798-9
По материалам данной статьи на портале PCRNEWS опубликован пресс-релиз «Геномная «шифровальная книга» – ключ к пониманию генной регуляции у человека».
[summary] =>
[format] => full_html
[safe_value] =>
Международная группа исследователей представила результаты масштабного проекта «Кодовая книга», посвящённого определению последовательностей ДНК, распознаваемых факторами транскрипции человека. Эти белки управляют активностью генов, однако для сотен из них сайты связывания оставались неизвестными, а для изученных – не всегда было ясно, насколько известные данные достоверны для живой клетки.
Авторы провели более 4000 экспериментов, сочетая методы in vitro и in vivo, и охарактеризовали 332 транскрипционных фактора. Мотивы связывания удалось получить для 177 белков (53% от общего числа), причём большинство из них оказались уникальными для одного конкретного фактора. Таким образом, словарь узнаваемых последовательностей расширен примерно на 130 новых мотивов.
В итоге в геноме человека идентифицированы десятки тысяч ранее неизвестных, эволюционно консервативных и прямых сайтов связывания транскрипционных факторов. Эти участки преимущественно локализованы в промоторных областях генов и позволяют прогнозировать уровень их экспрессии.
Проект «Кодовая книга» – это важный шаг в понимании механизмов реализации информации, содержащейся в геноме человека.
В консорциум Codebook (Кодовая книга) входят биоинформатики из Института белка РАН, доктор биологических наук Иван Кулаковский, аспиранты ИБ РАН – Георгий Мещеряков и Андрей Буян.
Результаты работы оформлены в статью:
Arttu Jolma, Kaitlin U. Laverty, Ali Fathi, Ally W. H. Yang, Isaac Yellan, Ilya E. Vorontsov, Antoni J. Gralak, Judith F. Kribelbauer-Swietek, Sachi Inukai, Rozita Razavi, Mihai Albu, Alexander Brechalov, Zain M. Patel, Vladimir Nozdrin, Georgy Meshcheryakov, Andrey Buyan, Ivan Kozin, Sergey Abramov, Alexandr Boytsov, The Codebook Consortium, Quaid Morris, Matthew T. Weirauch, Oriol Fornes, Vsevolod J. Makeev, Jan Grau, Ivo Grosse, Philipp Bucher, Bart Deplancke, Ivan V. Kulakovskiy & Timothy R. Hughes. An expanded codebook of human transcription factor DNA-binding specificity. // Nature. 2026. DOI: 10.1038/s41586-026-10798-9
По материалам данной статьи на портале PCRNEWS опубликован пресс-релиз «Геномная «шифровальная книга» – ключ к пониманию генной регуляции у человека».
[safe_summary] =>
)
)
)
